Composante
UFR Sciences Vie Terre Environnement
Liste des enseignements
Facultatif
S4 Génie génétique 2 (GEN-202)
Niveau d'étude
BAC +2
ECTS
3 crédits
Composante
UFR Sciences Vie Terre Environnement
Ce module participe pour l'élaboration d'une spécialité en
BCP (Biologie cellulaire et physiologie)
SVg (Sciences du Végétal)
PCB (préparation concours B)
Cet enseignement est suivi par un des 2 groupes étudiants de CyPI (groupe Agronomie ou groupe Alimentation)
Le génie génétique définit l’ensemble des techniques permettant d’identifier, d’isoler, de modifier et de transférer des gènes d'un organisme à un autre.
Le génie génétique fournit aux biologistes, quel que soit leur domaine de spécialité (biologie humaine, animale, végétale, microbienne) et l’échelle à laquelle ils travaillent (molécule, cellule, organisme, population), des approches expérimentales leur permettant d’élucider les mécanismes du vivant.
Ses champs d'application sont également multiples, les plus importants relevant des domaines de l’environnement, de l’agronomie et de la santé.
Dans cette UE, les étudiant.e.s acquerront les connaissances théoriques et pratiques de base du génie génétique et découvriront comment ses réalisations impactent notre vie en société.
Programme :
Cours magistraux (8h) et Travaux dirigés (8h)
Lors de ces enseignements les étudiant.e.s découvriront comment :
Définir des outils moléculaires appropriés afin de mener une expérimentation sur l’ADN (enzymes de restriction, modification, ligase, vecteurs plasmidiques, phagiques, navette, chromosomes artificiels)
Préparer de l’ADN (extraction, purification, amplification de l’ADN, électrophorèses analytiques et préparatives)
Introduire de l’ADN dans des cellules (transformation de bactérie et de cellules végétales, transfection de cellules animales)
Détecter un segment d’ADN spécifique dans un mélange complexe (notion de sonde, techniques de marquage, transfert sur membrane, hybridation)
Constituer et cribler des banques d'ADN (banques génomique, d'ADNc, d’expression)
Caractériser le polymorphisme de l’ADN (analyse de restriction, Southern, PCR, séquençage)
Conduire des expériences de transgénèses animale et végétale.
Travaux pratiques (9h)
Les étudiant.e.s réaliseront un clonage moléculaire allant de la préparation de l’ADN à cloner jusqu’à l’identification du clone recherché.
Techniques mises en œuvre :
- Amplification par PCR
- Transformation bactérienne
- Sélection et criblage de clones recombinants
- Analyse de restriction
S4 Biologie du développement 2 : Organogenèse (DEV-202)
Niveau d'étude
BAC +2
ECTS
3 crédits
Composante
UFR Sciences Vie Terre Environnement
Ce module participe pour l'élaboration d'une spécialité en
BCP (Biologie cellulaire et physiologie)
SVg (Sciences du Végétal)
SVT ME (Métiers de l'Enseignement en SVT)
PCB (Préparation au concours B)
Ce module a pour but de permettre aux participants de découvrir les notions fondamentales de la biologie du développement animal et végétal : morphogenèse, spécification et différenciation cellulaires, migration et/ou communication cellulaires, formation des tissus et des organes.
Le module présentera les organismes modèles et les diverses techniques (dont l’imagerie, la génétique et la biologie moléculaire) qui permettent de trouver des réponses sous forme d’une synthèse des connaissances actuelles.
Programme :
Cours magistraux (10h)
Principe et concepts en Biologie du développement d’organismes modèles :
Drosophile: embryogenèse (Détermination des polarités, territoires présomptifs, gastrulation, neurogenèse et métamérie) et développement post-embryonnaire (organogenèse et métamorphose), Grillon (embryogenèse), Nématode (Caenorhabditis elegans) (reproduction et embryogenèse) (8h).
Biologie du développement d’organismes modèles végétaux : fonctionnement des méristèmes et croissance continue, description des mécanismes fins de la régulation des activités d’histogenèse et d’organogénèse dans l’espace et dans le temps (2h).
Travaux dirigés (6h)
Les TD seront consacrés à l'étude des approches expérimentales de la biologie développementale et l'utilisation des techniques de génétique, de biologie moléculaire et cellulaire sur différents modèles animaux (4h) et végétaux (2h).
Travaux pratiques (9h)
Etude de l’organogenèse chez les animaux (4h)
Etudes histologiques de tissus en organogenèse végétale (5h)
S4 Immunité et Infection (IMM-202)
Niveau d'étude
BAC +2
ECTS
3 crédits
Composante
UFR Sciences Vie Terre Environnement
Ce module participe pour l'élaboration d'une spécialité en
BCP (Biologie cellulaire et physiologie)
SVT ME (Métiers de l'Enseignement en SVT)
PCB (Préparation au concours B)
Programme :
Cours magistraux :
Les différentes maladies infectieuses : diversité des agents infectieux, relations hôtes-pathogènes, mécanismes de pathogénèse
La réponse immunitaire aux infections bactériennes
La réponse immunitaire aux infections virales
La réponse immunitaire aux infections parasitaires et fongiques
Vaccination et sérothérapie
Exemples de quelques défis actuels en médecine humaine et vétérinaire
TD : Préparation d’exposés sur des exemples de pathologies infectieuses et d’approches d’immunothérapies
S4 Biologie Cellulaire 4 : Cellules dans leur contexte social (BC-204)
Niveau d'étude
BAC +2
ECTS
3 crédits
Composante
UFR Sciences Vie Terre Environnement
Ce module participe pour l'élaboration d'une spécialité en
BCP (Biologie cellulaire et physiologie)
SVT ME (Métiers de l'Enseignement en SVT)
PCB (Préparation au concours B)
Cet enseignement est suivi par les 2 groupes étudiants de CyPI (groupe Agronomie et groupe Alimentation)
Programme :
Cours magistraux :
Communication intra et extracellulaire (signalisation)
Jonctions cellulaires, adhésion et migration
Introduction des interactions cellules humaines/animales et micro-organismes
Les niches cellulaires
Approfondissement des techniques de microscopie et de biologie cellulaire
Tissus et interaction cellulaire pathologique
Travaux dirigés
La signalisation cellulaire
La migration cellulaire
Travaux pratiques
- interactions cellules humaines/animales et micro-organismes
- Adhérence des cellules normales versus cellules tumorales
S4 Microbiologie et biotechnologie (MIC-202)
Niveau d'étude
BAC +2
ECTS
3 crédits
Composante
UFR Sciences Vie Terre Environnement
Ce module participe pour l'élaboration d'une spécialité en
BCP (Biologie cellulaire et physiologie)
SVg (Sciences du Végétal)
PCB (Préparation au concours B)
Ce module est également suivi par les étudiants de CYPI
Programme :
Cours magistraux :
Généralités et rappel sur la diversité du monde microbien.
Sélection de souches d’intérêt.
Modifications génétiques des microorganismes.
Applications biotechnologiques des microorganismes (bactéries, archébactéries, champignons, eucaryotes unicellulaires et virus).
TD : Techniques de bases pour l’analyse en microbiologie / Manipulation de bactéries à des fins de recherche fondamentale et de biotechnologie.
TP : Observations de microorganismes.